More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4432 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  51.5 
 
 
203 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  47.51 
 
 
185 aa  177  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  46.74 
 
 
188 aa  174  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  45.21 
 
 
185 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.34 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  41.14 
 
 
167 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  41.14 
 
 
167 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.7 
 
 
171 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  35.64 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.18 
 
 
154 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.7 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  37.82 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  37.82 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  35.14 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  36.16 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  37.65 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  38.6 
 
 
156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  40.79 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.09 
 
 
202 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  35.85 
 
 
201 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.76 
 
 
192 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  32.98 
 
 
174 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.09 
 
 
202 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  35.48 
 
 
187 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  35.48 
 
 
187 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  35.22 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  35.22 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  38.6 
 
 
172 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  37.97 
 
 
185 aa  111  9e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.62 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  37.06 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  41.51 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  38.82 
 
 
173 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.49 
 
 
178 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  40.62 
 
 
187 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.46 
 
 
164 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  34.81 
 
 
201 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  44.03 
 
 
194 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  39.29 
 
 
154 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  37.65 
 
 
153 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  34.09 
 
 
203 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  38.01 
 
 
169 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35 
 
 
188 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  32.78 
 
 
188 aa  106  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  38.42 
 
 
158 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  37.91 
 
 
191 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  37.21 
 
 
177 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  37.01 
 
 
179 aa  105  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  38.61 
 
 
240 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.58 
 
 
169 aa  105  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  38.92 
 
 
178 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  34.39 
 
 
169 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  35.8 
 
 
164 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  38.92 
 
 
178 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.64 
 
 
162 aa  104  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  37.95 
 
 
164 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  39.61 
 
 
189 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  35.88 
 
 
196 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  37.06 
 
 
155 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  35.8 
 
 
164 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  42.77 
 
 
165 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  34.95 
 
 
177 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  36.84 
 
 
173 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  33.33 
 
 
192 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.33 
 
 
187 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  39.31 
 
 
168 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  35.76 
 
 
201 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.15 
 
 
168 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  39.79 
 
 
172 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.01 
 
 
171 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  33.33 
 
 
175 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  38.56 
 
 
170 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.33 
 
 
187 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.74 
 
 
147 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  35.29 
 
 
176 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  39.87 
 
 
174 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  38.82 
 
 
167 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  41.01 
 
 
216 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.15 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  37.21 
 
 
188 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  32.09 
 
 
182 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.73 
 
 
168 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  38.22 
 
 
166 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.73 
 
 
168 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  36.99 
 
 
180 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  35.76 
 
 
201 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  35.43 
 
 
152 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.36 
 
 
168 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.36 
 
 
168 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  38.73 
 
 
168 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.75 
 
 
176 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.78 
 
 
168 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  35.47 
 
 
174 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  38.46 
 
 
188 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.1 
 
 
147 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  35.39 
 
 
171 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  35.91 
 
 
190 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  35.84 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  34.18 
 
 
177 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>