More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1204 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  51.5 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  51.72 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  51.1 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  46.7 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40.98 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  44 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.96 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  45.45 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40.96 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  43.37 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  44 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  41.08 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  44.83 
 
 		 179 aa  124  9e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.16 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.16 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.33 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  42.17 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.26 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.98 
 
 		 168 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  41.57 
 
 		 177 aa  121  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.95 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  41.81 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  38.32 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.98 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.98 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  40.96 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  41.92 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.59 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.98 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  42.17 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  42.93 
 
 		 168 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  41.11 
 
 		 168 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  42.93 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  39.64 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  42.54 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  42.54 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  42.54 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  42.54 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  40.56 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  41.57 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  42.17 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  39.16 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  41.11 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.07 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  36.36 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.72 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  42.28 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  40.96 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  39.46 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  36.81 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.8 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.75 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.75 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.11 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42.11 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  41.1 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.04 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  39.13 
 
 		 166 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  40.72 
 
 		 167 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  41.81 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  36.2 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  36.2 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.82 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  38.25 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  38.04 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  41.32 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  37.7 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  39.63 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  39.05 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  36.42 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.82 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.82 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.25 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  39.41 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  42.07 
 
 		 147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3105  peptide deformylase  41.5 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402286  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  39.47 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  37.65 
 
 		 157 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.22 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  40.13 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  37.13 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.05 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.44 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  34.38 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  39.47 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.16 
 
 		 167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  40.96 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  36.93 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  42.95 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  39.18 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  38.04 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>