More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0944 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  100 
 
 		 217 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  71.43 
 
 		 217 aa  333  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  54.74 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  47.75 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  51.56 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  47.89 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  44.93 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  48.72 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  44.44 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  42.7 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  46.11 
 
 		 191 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  40.12 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  38.22 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  37.04 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  35.26 
 
 		 168 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  35.4 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  34.62 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  36.25 
 
 		 179 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  39.49 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  37.01 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.06 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.06 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  35.9 
 
 		 168 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.01 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  33.75 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  35.37 
 
 		 170 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.06 
 
 		 171 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  37.89 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  36.08 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  33.97 
 
 		 168 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  38.22 
 
 		 189 aa  89  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  35.9 
 
 		 168 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.12 
 
 		 178 aa  88.2  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  35.8 
 
 		 182 aa  88.2  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  35.9 
 
 		 177 aa  88.2  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  35.9 
 
 		 168 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  35.9 
 
 		 168 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  34.15 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  38.06 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.09 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  33.75 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.36 
 
 		 177 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  37.65 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  34.42 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  32.69 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  36.25 
 
 		 170 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  32.5 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  37.89 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  33.12 
 
 		 178 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  41.86 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  35.48 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  35.22 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  36.13 
 
 		 186 aa  85.1  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  32.72 
 
 		 191 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  34.01 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  33.33 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  34.13 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  35.9 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  35.67 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  38.12 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  37.43 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  34.39 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  32.09 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  37.5 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  34.62 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  30.77 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  35.03 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.93 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  36.09 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  35.96 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  36.71 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  34.01 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  37.23 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  37.98 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.1 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  35.17 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  37.21 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  36.31 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  35.06 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  33.73 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  35.77 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  35.54 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  35.67 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  33.33 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  35.44 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  35.39 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.41 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  33.54 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  30.77 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  37.88 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  34.42 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  34.16 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  35.67 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  38.76 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  37.12 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  32.14 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  37.91 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>