More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3474 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  100 
 
 		 175 aa  359  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6178  formylmethionine deformylase  40.49 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0426959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  43.05 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.66 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  38.22 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  39.87 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  41.55 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  35.8 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  37.11 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  37.11 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  35.43 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  38.27 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  38.61 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40.94 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  34.39 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.69 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  39.74 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  35.9 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.14 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.67 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  37.35 
 
 		 208 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  34.68 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  34.64 
 
 		 207 aa  98.6  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  37.33 
 
 		 151 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  34.91 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  34.91 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  39.6 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  38.31 
 
 		 549 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  37.33 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  35.29 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  37.33 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.43 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  36.18 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  37.06 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  34.76 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  35.88 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  32.2 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  34.29 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  37.91 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  36.36 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  35.03 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.14 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  32.37 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  36 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  34.24 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  32.35 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  34.67 
 
 		 204 aa  90.9  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  36 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  30.86 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  35.57 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  32.37 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  38.41 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  33.16 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  35.33 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  39.49 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  32.57 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  33.53 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  34.71 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  33.33 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.16 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  38.16 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  33.33 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  38.16 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  33.53 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  36.77 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1786  formylmethionine deformylase  34.23 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  33.53 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  33.14 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  32.35 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  36.13 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  31.84 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  31.79 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  32.35 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  33.33 
 
 		 227 aa  88.2  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  32.11 
 
 		 226 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  36.67 
 
 		 180 aa  87.8  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  38.16 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  32.37 
 
 		 187 aa  87.8  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  32.37 
 
 		 187 aa  87.8  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  33.14 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.65 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  32.54 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  34.76 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  33.97 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  34.29 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  36.31 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  38.03 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  33.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  31.17 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  33.97 
 
 		 201 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  38.68 
 
 		 240 aa  86.3  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  37.5 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  36.84 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  30.11 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  35.12 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  31.33 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  33.77 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  34.67 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  36 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  31.21 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>