More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1885 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  99.35 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  48 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  47.65 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  44.37 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.35 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  43.14 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  41.72 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  46.58 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  44.9 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  42.31 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  44.52 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.79 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  41.89 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  41.89 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  43.84 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  40.41 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  42.47 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  35.76 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40.51 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  42.47 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  37.11 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  44.52 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  41.78 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  38.51 
 
 		 173 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.22 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  40.41 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  42.18 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  41.5 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  40.41 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.91 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  41.1 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  40.41 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  44.3 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  40.79 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  40.82 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.19 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40.25 
 
 		 193 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  38.67 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  39.73 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  41.89 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  38 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  41.89 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  41.78 
 
 		 169 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  39.04 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  43.05 
 
 		 182 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  39.04 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  34.59 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  41.1 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  42.47 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.16 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  41.22 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  41.1 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  36 
 
 		 187 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  40.41 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  41.5 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  38 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.36 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  35.88 
 
 		 207 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  36.13 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  41.22 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  36 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  40.41 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.16 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  39.73 
 
 		 201 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  40.41 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  40.41 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  38.36 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  38.36 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  41.5 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  37.82 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  41.5 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  37.93 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  40.41 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  38.56 
 
 		 201 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  41.5 
 
 		 216 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  41.5 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  41.5 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  41.5 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.16 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  39.73 
 
 		 184 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  37.33 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  41.5 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  39.73 
 
 		 201 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  38 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>