More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1831 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  89.67 
 
 		 184 aa  346  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  71.2 
 
 		 208 aa  284  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  70.65 
 
 		 184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  70.65 
 
 		 184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  70.65 
 
 		 184 aa  279  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  279  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  70.11 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  57.92 
 
 		 183 aa  219  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  57.92 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  57.92 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  53.93 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  53.44 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  52.69 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  49.74 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  48.37 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  48.89 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  44.57 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  44.12 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  38.33 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  37.04 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  36.67 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  41.25 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  35.67 
 
 		 171 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.13 
 
 		 164 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  45.54 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.13 
 
 		 154 aa  91.7  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  43.36 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  42.48 
 
 		 172 aa  87.8  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  37.33 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  37.33 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  44.17 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  37.27 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  36.47 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  38.36 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35 
 
 		 169 aa  84.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  37.34 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  34.52 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  37.34 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  32.8 
 
 		 172 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  41.59 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  37.75 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  46.79 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  43.1 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  35.93 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  35.03 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  47.71 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  34.73 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  36.14 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  41.74 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  32.76 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  35.03 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  34.62 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  45.87 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  35.12 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.33 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.18 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  36.36 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  42.11 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  35.93 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  33.94 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  36.31 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  36.84 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  40.52 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  33.73 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  36.84 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  36.75 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  30.06 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  39.64 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.29 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  41.74 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  33.33 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  35.8 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  30.39 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  33.76 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  39.66 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  33.33 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  33.93 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  36.54 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  31.71 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  32.34 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  40 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  36 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  36.28 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  33.33 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  35.22 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  34.52 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  35.54 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  33.33 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  35.71 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  37.75 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.35 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>