More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1182 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  60.22 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  53.51 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  51.31 
 
 		 204 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  50.28 
 
 		 208 aa  191  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  52.17 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  48.89 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  48.89 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  48.89 
 
 		 184 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  48.89 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  48.33 
 
 		 184 aa  185  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  48.17 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  48.37 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  47.54 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  46.15 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  48.62 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  48.62 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  48.09 
 
 		 183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  35.23 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  34.39 
 
 		 200 aa  98.6  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  34.62 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  33.71 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  37.27 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.22 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.22 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  38.82 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  32.97 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  34.09 
 
 		 158 aa  85.1  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  34.83 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  34.83 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  32.93 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  35.22 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  34.13 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  39.38 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  38.46 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  35.62 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  32.53 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  32.97 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  35.22 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.48 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  32.35 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.33 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  36.42 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  33.96 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  34.34 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  32.93 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  35 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  35 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  33.54 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  33.54 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  35.19 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  32.08 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  31.22 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  35.8 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  35 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  38.15 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  30.65 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4118  formylmethionine deformylase  31.61 
 
 		 506 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4540  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 506 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129106  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  30.94 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  32.39 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  31.11 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  32 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  35.37 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  33.53 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  35.62 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  32.05 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  38.36 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.72 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  32.1 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  32.53 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  33.53 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  32.4 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  36.14 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  32.48 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  33.53 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  31.1 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  35.54 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  33.14 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  34.38 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  31.25 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  35.58 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  29.65 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  35.86 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  32.91 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  29.24 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  33.12 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  35.26 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  30.82 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  32.7 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  31.46 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  35.48 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  35.48 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>