More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0581 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  72.68 
 
 		 204 aa  308  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  65.84 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  52.11 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  51.58 
 
 		 184 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  50.79 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  50.79 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  50.79 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  50.79 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  50.79 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  50.53 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  50.53 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  49.74 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  49.47 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  50.53 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  49.22 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  47.69 
 
 		 186 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  46.15 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  49.73 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  49.73 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  48.13 
 
 		 183 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  45.26 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  45.88 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  36.32 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  33.51 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  36.42 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  31.72 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  33.33 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  34.04 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  36.23 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  37.31 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  33.93 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  35.61 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  36.69 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  35.1 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  32.37 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  36.22 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  34.56 
 
 		 171 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  33.82 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  28.89 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  34.53 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  31.79 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  30.77 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  31.03 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  35.66 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  30.64 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  32.4 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  31.17 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  36.84 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  33.81 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  32.33 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  31.84 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  32.94 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  32.18 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  30.92 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  30.92 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  30.85 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  36.84 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  32.33 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  34.44 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  31.82 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  35 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  31.58 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  35.34 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  33.09 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  33.09 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1508  peptide deformylase  34.56 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  32 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  33.08 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  30.94 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  34.59 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.77 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  33.71 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  35.34 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.77 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  36.29 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  34.38 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  32.59 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  32.07 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  29.35 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  32.65 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  31.36 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  35.34 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  35.34 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  31.07 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  30.61 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  33.73 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  33.83 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  33.33 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  29.41 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  36.22 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  30.11 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  32.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  31.82 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  32.33 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  33.86 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  32.82 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  31.84 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  28.99 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>