More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4023 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  98.37 
 
 
184 aa  374  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  98.37 
 
 
184 aa  374  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  98.37 
 
 
184 aa  374  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  98.37 
 
 
184 aa  374  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  97.28 
 
 
184 aa  370  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  96.2 
 
 
184 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  95.65 
 
 
184 aa  367  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  91.85 
 
 
184 aa  353  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  86.96 
 
 
208 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  71.74 
 
 
184 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  70.65 
 
 
184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  60.56 
 
 
183 aa  223  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  60.56 
 
 
183 aa  223  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  59.2 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  54.4 
 
 
186 aa  207  8e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  53.23 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  54.1 
 
 
204 aa  197  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  50.53 
 
 
211 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  48.89 
 
 
184 aa  188  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  49.19 
 
 
192 aa  184  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  46.11 
 
 
185 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  38.17 
 
 
185 aa  128  6e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  40.36 
 
 
200 aa  125  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  37.22 
 
 
198 aa  123  1e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  40.96 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  36.67 
 
 
198 aa  114  6e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  44.35 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  43.2 
 
 
167 aa  98.2  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  43.2 
 
 
167 aa  98.2  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.95 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.49 
 
 
154 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.8 
 
 
164 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  43.55 
 
 
167 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  41.67 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  41.67 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  34.88 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.43 
 
 
174 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  35.54 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  35.09 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  35.5 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  45.16 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  34.94 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  35.59 
 
 
172 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  34.94 
 
 
185 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.53 
 
 
171 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.97 
 
 
172 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  33.33 
 
 
171 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  34.43 
 
 
172 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  40.65 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  35.88 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  41.8 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  40.65 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  36.65 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  37.13 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  35.47 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  34.27 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  33.33 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  37.11 
 
 
154 aa  84.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  33.73 
 
 
155 aa  84.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  40.5 
 
 
172 aa  84.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  41.27 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.15 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  41.8 
 
 
147 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  38.75 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  34.09 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.11 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  38.1 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  37.11 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  33.73 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  35.8 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  39.87 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  34.81 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.72 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  34.3 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  41.8 
 
 
147 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  39.2 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  33.89 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.21 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  36.03 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  33.89 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  38.52 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  38.84 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  39.52 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  39.69 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  34.13 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  39.52 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  35.37 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  32.94 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  31.71 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  36.89 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.05 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  33.53 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  30.11 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.05 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  40 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  37.17 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  35.76 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  33.33 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>