More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0678 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  80.87 
 
 		 183 aa  319  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  80.87 
 
 		 183 aa  319  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  57.38 
 
 		 184 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  57.92 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  57.22 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  59.2 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  59.2 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  59.2 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  213  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  213  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  213  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  58.62 
 
 		 184 aa  213  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  49.19 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  50.54 
 
 		 204 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  50 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  48.09 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  48.13 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  45.65 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  48.9 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  37.99 
 
 		 198 aa  114  6e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  41.92 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  35.75 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  42.21 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  36.14 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.87 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  33.14 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  35.37 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  34.3 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  29.83 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  43.33 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  32.58 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  36.36 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  34.18 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  41.74 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  31.4 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  34.66 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  42.34 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  32.47 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  39.83 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  32.47 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  41.74 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  39.32 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  34.76 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  39.64 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  33.33 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  36.36 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  38.74 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  42.86 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  36.96 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.15 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  33.14 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  31.18 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  33.14 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  32.8 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  38.84 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  38.75 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.22 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.64 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.35 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  42.24 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  39.29 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  34.65 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  34.65 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  44.04 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  33.54 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  41.96 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.38 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  41.88 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  41.88 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  38.98 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  38.57 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  31.64 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.38 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  30.9 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.44 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  36.52 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  32.34 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  33.33 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  39.45 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  31.74 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  41.07 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  33.96 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.88 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  34.39 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.07 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  33.13 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  38.74 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  41.74 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  41.32 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>