More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0630 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  62.57 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  60.22 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  56.52 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  55.49 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  54.4 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  54.4 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  54.4 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  54.95 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  55.31 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  54.75 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  54.75 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  54.75 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  54.75 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  52.49 
 
 		 208 aa  201  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  52.51 
 
 		 204 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  52.69 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  52.2 
 
 		 204 aa  195  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  51.35 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  51.35 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  52.69 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  49.19 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  47.69 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  39.38 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  36.84 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  39.01 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  37.37 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  37.36 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  38.01 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  35.5 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.81 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  36.78 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  36.59 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  36.69 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  39.26 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  33.91 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  34.91 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  34.12 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  37.2 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.88 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  36.53 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  34.91 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  36.97 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  36.09 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  35.12 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  30.95 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  34.12 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  36.81 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  35.63 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  30.95 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  33.92 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  39.5 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  32.74 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  33.66 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  41.23 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  35.33 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  36.69 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  34.55 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  34.55 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  35.37 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  34.68 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  35.33 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  37.3 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  35.26 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  33.15 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  36.26 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.41 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  36.05 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  34.2 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  35.47 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.37 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  40.17 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  36.31 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  33.54 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  36.59 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  36.59 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  33.73 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  30.59 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.02 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  36.02 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  34.94 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  34.3 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  35.15 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  32.52 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  38.52 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  33.53 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  35.37 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  35.37 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  33.94 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  35.4 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  33.73 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  32.07 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  38.51 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  31.84 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  37.72 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  33.53 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  34.15 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  35.98 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  33.54 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>