More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1895 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  79.9 
 
 
204 aa  350  8.999999999999999e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  65.84 
 
 
211 aa  281  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  53.44 
 
 
184 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  52.6 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  52.6 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  52.6 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  52.6 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  52.6 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  52.6 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  52.69 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  52.6 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  54.1 
 
 
184 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  54.1 
 
 
184 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  53.3 
 
 
184 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  52.15 
 
 
184 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  52.51 
 
 
186 aa  195  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  48.17 
 
 
184 aa  185  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  51.65 
 
 
183 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  51.65 
 
 
183 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  50.54 
 
 
183 aa  177  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  45.5 
 
 
185 aa  175  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  47.03 
 
 
192 aa  168  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  37.43 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  32.8 
 
 
185 aa  102  4e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  33.15 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  36.47 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  30.94 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  34.32 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  34.68 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  33.15 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  36.97 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  32.09 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  31.07 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  39.42 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  34.1 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  38.28 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  31.58 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  31.76 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  37.96 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  33.33 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  31.21 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  32.97 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  32.07 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  33.13 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  33.72 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  36.36 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  31.49 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  33.33 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  32.6 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  30.46 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  27.94 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  29.1 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  29.1 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  33.73 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  37.32 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  29.94 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  34.67 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  33.33 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  34.3 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  28.04 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  35 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1409  peptide deformylase  35.94 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  37.29 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  32.56 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  35.83 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  31.15 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  34.17 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  32.61 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  33.53 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  35.34 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  32.77 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  33.57 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  34.88 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  31.58 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  29.26 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  32.26 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  34.25 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  32.93 
 
 
172 aa  72  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  31.89 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  29.63 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  32.16 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  34.11 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  37.01 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  30.59 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  30.72 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  32.82 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  29.35 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  32.3 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  34.68 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  35.77 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  31.4 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  32.85 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  32 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  33.06 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  32.85 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  31.29 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  30.46 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  33.88 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  29.35 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>