More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1345 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  62.57 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  59.46 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  53.51 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  50.27 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  49.19 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  49.19 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  48.65 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  48.65 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  48.11 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  48.11 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  48.11 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  48.11 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  48.11 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  48.11 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  48.89 
 
 		 184 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  46.74 
 
 		 184 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  48.04 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  48.04 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  45.65 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  47.03 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  45.26 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  46.45 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  40.53 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  34.25 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  40.94 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  35.56 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  39.64 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  35.36 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  35.84 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  38.04 
 
 		 167 aa  84.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  35.58 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  36.07 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  35.09 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  35.83 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  35.93 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  34.86 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  34.48 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  35.58 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  41.67 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  31.61 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  34.36 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.12 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  41.67 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.5 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  38.14 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  34.97 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  36.81 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  40.17 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  35.82 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  35.58 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  36 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.32 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  32.93 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  33.71 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  37.44 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  32.97 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  34.46 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  33.53 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  33.53 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  34.97 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  34.68 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  35.71 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  35.33 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  35.33 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  36.47 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  33.7 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  28.8 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  35.58 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  34.16 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  36.09 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  34.68 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  38.84 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  35.5 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  35.58 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  33.51 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  38.33 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  33.93 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  39.83 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  35.15 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  36.9 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  38.58 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  35.58 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  33.92 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.65 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  34.88 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  34.94 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  33.13 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  37.07 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  32.39 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  37.5 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  38.14 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  34.36 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  38.02 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  33.72 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  36.09 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  39.66 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  39.34 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  39.67 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  41.67 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>