More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0205 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  79.9 
 
 
204 aa  350  8.999999999999999e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  72.68 
 
 
211 aa  308  4e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  53.93 
 
 
184 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  53.76 
 
 
184 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  53.12 
 
 
184 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  52.15 
 
 
208 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  53.23 
 
 
184 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  52.69 
 
 
184 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  53.23 
 
 
184 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  52.41 
 
 
184 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  52.41 
 
 
184 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  52.41 
 
 
184 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  53.23 
 
 
184 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  52.41 
 
 
184 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  52.41 
 
 
184 aa  197  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  52.2 
 
 
186 aa  195  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  51.31 
 
 
184 aa  194  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  53.3 
 
 
183 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  53.3 
 
 
183 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  50 
 
 
183 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  46.45 
 
 
192 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  45.83 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  35.98 
 
 
185 aa  108  5e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  38.24 
 
 
200 aa  106  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  34.25 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  32.6 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  35.29 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  36.67 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  32.95 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  33.9 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  33.9 
 
 
178 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  31.76 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  34.3 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  33.13 
 
 
154 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  36.09 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  32.2 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  31.18 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  39.85 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  32.75 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  37.32 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  31.49 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  37.4 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  34.59 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  37.12 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0163  peptide deformylase  36.51 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  35.33 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  31.11 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  31.98 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  34.12 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  34.59 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  39.06 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  35.83 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  32.2 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  30.9 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  30.32 
 
 
168 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.89 
 
 
174 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  30.98 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  32.76 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  34.62 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  29.68 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  29.38 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  34.85 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  35.82 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  34.59 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  33.09 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  35.4 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  33.33 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  32.62 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  33.33 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  34.31 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  34.68 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  34.15 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  33.06 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  37.82 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  32.57 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  30.81 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  34.09 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  32.79 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  36.3 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  35.54 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  34.06 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  30.41 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1493  peptide deformylase  34.09 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.977447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  35.51 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.86 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  29.38 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  36.36 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  28.11 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  33.08 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  36.36 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.12 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  34.65 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  33.08 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  30.29 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  30.41 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  35.48 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  28.96 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>