More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0206 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  61.42 
 
 		 200 aa  263  2e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  44.12 
 
 		 184 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  43.27 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  42.17 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  40.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  43.05 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  43.05 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  40.96 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  36.84 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  41.57 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  41.57 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  41.92 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  42.11 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  36.7 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  37.5 
 
 		 185 aa  111  9e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  35.64 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  37.43 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  38.82 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  36.47 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  38.27 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  36.21 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  36.21 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  34.43 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  38.66 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  35.11 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  34.35 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  34.17 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  34 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  37.93 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  34.68 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  35.9 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  30.53 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  30.32 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  31.03 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  33.59 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.67 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  35.04 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  31.45 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  35 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  31.45 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  33.33 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  31.45 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  34.31 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  31.03 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  35.71 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  36.36 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  40.87 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  29.23 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4706  formylmethionine deformylase  31.5 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  38.26 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  29.03 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  31.25 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  32.76 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  35.25 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  29.48 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  36.21 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  31.62 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  33.87 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  30.92 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  36.61 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  36.52 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  30.92 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  36.51 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  32.76 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  31.03 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4272  formylmethionine deformylase  30.95 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.203569  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  31.03 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  31.14 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  30.77 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  31.03 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  31.79 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  33.62 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  36.36 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  34.68 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  30.36 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  35.65 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  33.05 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  34.75 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  32.52 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  35.71 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  32.52 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  28.07 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>