More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0510 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  100 
 
 		 198 aa  411  1e-114  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  90.4 
 
 		 198 aa  375  1e-103  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  42.01 
 
 		 208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  38.33 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  38.33 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  37.22 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  38.42 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  37.22 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  37.22 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  37.22 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  37.85 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  37.85 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  37.85 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  37.85 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  36.11 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  37.99 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  39.01 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  36.31 
 
 		 183 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  36.31 
 
 		 183 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  35.64 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  33.87 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  33.51 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  35.71 
 
 		 185 aa  95.5  5e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  33.15 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  34.25 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  34.62 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  35.56 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  31.69 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  31.48 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  39.64 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  33.14 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  38.89 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  37.96 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  37.04 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  37.04 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  37.04 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  37.84 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  36.61 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  36.52 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  36.11 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  34.67 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  28.74 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  32.5 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  34.82 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  32.92 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  34.82 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  36.84 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  37.04 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  36.36 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  37.96 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  33.63 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  33.63 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  37.04 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  37.04 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  34.82 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  38.6 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  37.04 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  29.14 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  35.19 
 
 		 169 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  31.68 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  31.68 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  32.3 
 
 		 171 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  37.27 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  34.11 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  38.94 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  32.74 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  33.63 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  36.36 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  37.04 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  28.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  33.63 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  30.95 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  36.04 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.04 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  28.66 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  34.21 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  39.13 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  31.06 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  28.3 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  36.04 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  38.94 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  31.68 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  36.04 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  28.14 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  36.04 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>