More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0238 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0238  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 368 aa  718    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0246  Type II secretory pathway component PulD-like protein  39.58 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  26.32 
 
 		 686 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42350  Type III secretion outer membrane protein PscC precursor  26.94 
 
 		 600 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.51 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  28.84 
 
 		 1282 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  26.34 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  28.41 
 
 		 1282 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.84 
 
 		 1421 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  27.49 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28.11 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 655 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3917  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.41 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3830  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.41 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  26.11 
 
 		 580 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  25.38 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  25 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 640 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 640 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 640 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.78 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  24.18 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.78 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.78 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3208  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.78 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01700  hypothetical protein  25.51 
 
 		 623 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.78 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  26.59 
 
 		 696 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  25.82 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4149  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  25.5 
 
 		 567 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0153519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  27.16 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5918  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.44 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033473  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  24.09 
 
 		 682 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  23.64 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  26.34 
 
 		 662 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  24.91 
 
 		 696 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  25.56 
 
 		 787 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  24.57 
 
 		 696 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  22.68 
 
 		 745 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  24.63 
 
 		 670 aa  69.3  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  25.19 
 
 		 752 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  24.42 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  26.35 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  26.64 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  23.44 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1985  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  24.07 
 
 		 711 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  24.45 
 
 		 673 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2997  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.89 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  26.01 
 
 		 655 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  24.6 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  25.84 
 
 		 758 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  22.41 
 
 		 805 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  23.4 
 
 		 807 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  26.8 
 
 		 495 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  24.48 
 
 		 717 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 		 649 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  24 
 
 		 833 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  25 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0639  type II and III secretion system protein  28.25 
 
 		 596 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  22.63 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.02 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  26.27 
 
 		 748 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  22.3 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  22.98 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1893  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.18 
 
 		 588 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  23 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  23.4 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  21.53 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  23.86 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  25.11 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  24.15 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  25.72 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  25.09 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  25.09 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  26.27 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  24.31 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  26.2 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0319  type II and III secretion system protein  26.63 
 
 		 818 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0418  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.18 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3132  putative type III secretion hypersensitivity response secretion protein, HrcC/HrpA1- like  21.1 
 
 		 736 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15642  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  24.77 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  22.26 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  24.9 
 
 		 751 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  25.49 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  23.42 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  22.26 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1907  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  23.75 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.32 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2192  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  22.57 
 
 		 689 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.88 
 
 		 683 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.34 
 
 		 894 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  25.84 
 
 		 714 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  25.81 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  21.11 
 
 		 781 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  26.19 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>