More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2288 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2288  diguanylate cyclase  100 
 
 		 358 aa  730    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3895  diguanylate cyclase  41.83 
 
 		 355 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  35.47 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  40.35 
 
 		 629 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 548 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 559 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  36.45 
 
 		 533 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1863  diguanylate cyclase  26.96 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.150647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.01 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0636  sensory box/GGDEF family protein  40 
 
 		 642 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.65 
 
 		 550 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  34.34 
 
 		 569 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 565 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  31.47 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  31.47 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  31.47 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  31.47 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 583 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  33.07 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  35.27 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  36.6 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.05 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  33.04 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4178  response regulator receiver protein  38.29 
 
 		 1477 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.450705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.05 
 
 		 646 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4136  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.23 
 
 		 630 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  35.32 
 
 		 405 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3587  diguanylate cyclase  28.53 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.684884  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 202 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  38.75 
 
 		 532 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  35.41 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  35.41 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  32.72 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3046  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.641394  normal  0.406701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  36.56 
 
 		 556 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4046  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.170449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3910  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 537 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283041  normal  0.244259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  38.14 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0619  response regulator receiver protein  36.16 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  38.37 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  34.41 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  35.68 
 
 		 585 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2363  GGDEF domain-containing protein  35.43 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.282615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  32.14 
 
 		 411 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003591  GGDEF family protein  42 
 
 		 489 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  34.34 
 
 		 474 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.01 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2800  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.05 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  31.84 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  33.84 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0893  diguanylate cyclase  31.94 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.440044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  31.43 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.96 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  37.11 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4234  diguanylate cyclase  41.48 
 
 		 539 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.256126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  35.32 
 
 		 736 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  31.88 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  31.23 
 
 		 546 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3549  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 527 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3016  GGDEF domain-containing protein  34.91 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0864603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0318  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.73 
 
 		 612 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1205  diguanylate cyclase  29.29 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  38.55 
 
 		 634 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1813  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  34.29 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  30.57 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.67 
 
 		 628 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4621  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.08 
 
 		 648 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334588  normal  0.654105 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  34.69 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  33.19 
 
 		 494 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3537  GGDEF family protein  34.43 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.31 
 
 		 772 aa  99.8  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  38.41 
 
 		 512 aa  99.8  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  34.69 
 
 		 316 aa  99.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0798  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.82 
 
 		 622 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.131749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 522 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.51 
 
 		 419 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1169  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.8 
 
 		 596 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0093  diguanylate cyclase  36 
 
 		 426 aa  99.4  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1888  diguanylate cyclase  32.34 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  38.29 
 
 		 512 aa  99.4  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3627  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 526 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4904  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.5 
 
 		 642 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0484368  normal  0.638753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  41.07 
 
 		 490 aa  99.4  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  37.63 
 
 		 574 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1806  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 744 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 517 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2144  diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  39.77 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2229  GGDEF domain protein  37.62 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>