More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0381 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0381  diguanylate cyclase  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.874327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1022  GGDEF domain-containing protein  40.56 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.219718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1057  GGDEF domain-containing protein  40.16 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2144  diguanylate cyclase  44.22 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9505  GGDEF domain-containing protein  36.18 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  41.71 
 
 		 625 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  41.71 
 
 		 625 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  41.71 
 
 		 625 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  40.96 
 
 		 625 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2370  diguanylate cyclase  40.41 
 
 		 554 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 621 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 624 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 628 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  40.64 
 
 		 628 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3016  GGDEF domain-containing protein  42.44 
 
 		 385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0864603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4688  diguanylate cyclase  36.48 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.104473 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3611  diguanylate cyclase  36.48 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 623 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  39.69 
 
 		 628 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  42.86 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2154  GGDEF  41.48 
 
 		 411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 641 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  36.52 
 
 		 368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  37.08 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1436  two-component response regulator  42.33 
 
 		 327 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  42.26 
 
 		 525 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2432  hypothetical protein  39.47 
 
 		 551 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0618  GGDEF domain-containing protein  30.21 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0891  diguanylate cyclase  40.79 
 
 		 332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1928  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.851461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  37.63 
 
 		 621 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1780  diguanylate cyclase  42.69 
 
 		 334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  35.93 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  35.57 
 
 		 628 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 354 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  39.15 
 
 		 467 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5204  diguanylate cyclase  36.4 
 
 		 466 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  31.43 
 
 		 364 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  38.79 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0023  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 584 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0108472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1980  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2682  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  37.43 
 
 		 596 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  38.54 
 
 		 628 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 622 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  39.89 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 466 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5582  diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2147  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.79 
 
 		 410 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1926  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 466 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6176  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 466 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  37.78 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2310  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 555 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2700  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 555 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1085  putative sensory box/GGDEF family protein  38.01 
 
 		 430 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 490 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2593  diguanylate cyclase  33.73 
 
 		 569 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1174  GGDEF domain-containing protein  35.05 
 
 		 431 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 420 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  34.57 
 
 		 333 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4493  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 332 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  37.43 
 
 		 430 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  41.67 
 
 		 525 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  34.17 
 
 		 354 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2989  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 577 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3428  diguanylate cyclase  41.07 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 631 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  38.31 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1684  GGDEF  31.65 
 
 		 354 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.419665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  38.42 
 
 		 624 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  35.08 
 
 		 641 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  37.23 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  37.85 
 
 		 363 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  40.46 
 
 		 459 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3066  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  37.16 
 
 		 532 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  38.29 
 
 		 556 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1418  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 610 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1449  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3873  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 430 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.65 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1371  diguanylate cyclase  35.66 
 
 		 466 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2173  diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  39.31 
 
 		 462 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 466 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 466 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 359 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0645  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00398  hypothetical protein  38.54 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  0.618685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.65 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3824  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 659 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1491  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 562 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  34.81 
 
 		 689 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>