More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2607 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  100 
 
 
316 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1380  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  54.11 
 
 
332 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3577  GGDEF domain-containing protein  52.13 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  53.57 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  51.27 
 
 
323 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  50.65 
 
 
319 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  50.32 
 
 
320 aa  349  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  49.68 
 
 
323 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  50.32 
 
 
318 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0569  sensory box/GGDEF family protein  49.37 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  47.15 
 
 
324 aa  335  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  48.53 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3794  diguanylate cyclase  48.42 
 
 
328 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.807786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  50.32 
 
 
321 aa  333  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  47.15 
 
 
324 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  47.15 
 
 
324 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0531  diguanylate cyclase  48.1 
 
 
328 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3737  diguanylate cyclase  48.1 
 
 
328 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251056  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3920  diguanylate cyclase  48.1 
 
 
328 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00763336  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3306  diguanylate cyclase  47.47 
 
 
324 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0921  putative GGDEF protein  47.76 
 
 
322 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  47.4 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0615  diguanylate cyclase  46.3 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000794548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02241  hypothetical protein  44.01 
 
 
320 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03704  GGDEF domain protein  47.83 
 
 
325 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  43.12 
 
 
280 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4141  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.81 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  40.54 
 
 
334 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3170  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.81 
 
 
312 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256904  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0014  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.81 
 
 
312 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.927772  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4956  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.81 
 
 
324 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0364888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5684  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.47 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656373  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5509  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.47 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2363  GGDEF domain-containing protein  41.14 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.282615  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5175  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.47 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2105  GGDEF domain-containing protein  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1493  GGDEF domain-containing protein  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00779791  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3279  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0418707  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1413  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1133  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.047255  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3165  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2399  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4551  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.14 
 
 
313 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111866  normal  0.524526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
312 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.47 
 
 
312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  36.57 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.21 
 
 
301 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.16 
 
 
315 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03099  sensory box/GGDEF protein  54.35 
 
 
163 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.727422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1752  diguanylate cyclase  31.19 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000321576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1040  sensory box protein  47.33 
 
 
160 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0887  sensory box protein  46.67 
 
 
160 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141659  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.04 
 
 
550 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  31.33 
 
 
328 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  42.02 
 
 
350 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0198  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
312 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3853  diguanylate cyclase  38.71 
 
 
359 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1616  GGDEF domain protein  45.73 
 
 
358 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.515769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  43.55 
 
 
764 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1887  diguanylate cyclase  32.7 
 
 
327 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  43.55 
 
 
764 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.61 
 
 
314 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3726  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 
145 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  38.12 
 
 
439 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  43.55 
 
 
764 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
758 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.6 
 
 
424 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3763  GGDEF  44.79 
 
 
358 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.64 
 
 
419 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  46.2 
 
 
308 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  39.67 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.89 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  43.71 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.32 
 
 
730 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  46.2 
 
 
498 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  40.43 
 
 
345 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
464 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
624 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06227  hypothetical protein  44.88 
 
 
146 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.69 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  46.84 
 
 
487 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000473  hypothetical protein  44.88 
 
 
145 aa  146  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.5 
 
 
469 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.39 
 
 
578 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
464 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1086  hypothetical protein  43.7 
 
 
148 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.394115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  41.12 
 
 
459 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2049  diguanylate cyclase  40.24 
 
 
357 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1583  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.35 
 
 
444 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185074  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
487 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.51 
 
 
769 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  39.8 
 
 
659 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.52 
 
 
306 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  36.55 
 
 
339 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
569 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.6 
 
 
791 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  42.54 
 
 
641 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
411 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  38.81 
 
 
775 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.79 
 
 
797 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>