More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1231 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  50.5 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  39.67 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 229 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  37.36 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  34.33 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  38.55 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.08 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  23.16 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  25.86 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>