More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2298 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  100 
 
 		 1093 aa  2248    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  43.75 
 
 		 1046 aa  904    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  25.47 
 
 		 1054 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  24.91 
 
 		 1024 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.3 
 
 		 1407 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  26.89 
 
 		 1370 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  25.26 
 
 		 1388 aa  237  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.97 
 
 		 1397 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  24.02 
 
 		 1526 aa  234  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.77 
 
 		 1070 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  25.3 
 
 		 1374 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  26.21 
 
 		 1194 aa  216  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.36 
 
 		 1105 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  24.2 
 
 		 1404 aa  210  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 		 1498 aa  211  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.44 
 
 		 1396 aa  202  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.99 
 
 		 1414 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  23.93 
 
 		 1373 aa  201  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  23.56 
 
 		 1400 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.89 
 
 		 1355 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  22.23 
 
 		 1063 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.75 
 
 		 1363 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  23.5 
 
 		 1373 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.84 
 
 		 1114 aa  197  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.66 
 
 		 1118 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.28 
 
 		 1070 aa  196  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  23.89 
 
 		 1278 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  24.53 
 
 		 987 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.52 
 
 		 1093 aa  183  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.13 
 
 		 1342 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.43 
 
 		 1340 aa  181  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  22.16 
 
 		 1347 aa  180  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  22.36 
 
 		 1374 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  23.27 
 
 		 1418 aa  178  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  23.6 
 
 		 1378 aa  177  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  23.26 
 
 		 1086 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  23.13 
 
 		 1053 aa  175  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  21.77 
 
 		 1017 aa  174  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  21.73 
 
 		 1384 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.91 
 
 		 1079 aa  170  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  24.05 
 
 		 1250 aa  168  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.08 
 
 		 1276 aa  167  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  22.84 
 
 		 1034 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  21.33 
 
 		 1185 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  25.03 
 
 		 1378 aa  163  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.53 
 
 		 1334 aa  159  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  22.21 
 
 		 1093 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  22.84 
 
 		 1004 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.2 
 
 		 1486 aa  157  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  22.81 
 
 		 1278 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.81 
 
 		 1505 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 1258 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 1226 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 1242 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  23.54 
 
 		 1502 aa  154  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.82 
 
 		 1504 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  22.36 
 
 		 1316 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  23.53 
 
 		 1306 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.99 
 
 		 1508 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 1237 aa  151  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  23.32 
 
 		 1344 aa  151  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  21.63 
 
 		 1515 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  23.06 
 
 		 1374 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.16 
 
 		 1504 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.07 
 
 		 1508 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  22.18 
 
 		 1346 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 484 aa  147  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.07 
 
 		 1508 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  21.97 
 
 		 1327 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 1030 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.64 
 
 		 1508 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.71 
 
 		 1511 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.67 
 
 		 1181 aa  141  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.63 
 
 		 1351 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 359 aa  140  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  22.15 
 
 		 1366 aa  138  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 490 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  20.49 
 
 		 954 aa  135  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  31.62 
 
 		 671 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  32.05 
 
 		 670 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  24.28 
 
 		 1355 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  30.84 
 
 		 795 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  32.2 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  21.27 
 
 		 1084 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 644 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  21.35 
 
 		 1175 aa  129  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 541 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.79 
 
 		 373 aa  129  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 795 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  23.22 
 
 		 1324 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.14 
 
 		 1005 aa  127  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 795 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  21.86 
 
 		 1313 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 799 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 		 1211 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.78 
 
 		 797 aa  126  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 795 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 541 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.11 
 
 		 683 aa  125  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 687 aa  125  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>