More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0797 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  44.61 
 
 		 1033 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1001 aa  1968    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  42.72 
 
 		 1014 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  40.84 
 
 		 995 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.04 
 
 		 1010 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  39.98 
 
 		 1003 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  42.03 
 
 		 990 aa  575  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  38.53 
 
 		 983 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  36.72 
 
 		 1027 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  39.28 
 
 		 1003 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.46 
 
 		 1030 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 1025 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 1071 aa  354  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  41.31 
 
 		 921 aa  353  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.31 
 
 		 1022 aa  350  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  42.59 
 
 		 1088 aa  345  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 981 aa  340  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 		 907 aa  334  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.17 
 
 		 990 aa  330  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 940 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 919 aa  327  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  40.95 
 
 		 930 aa  324  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.87 
 
 		 934 aa  323  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 946 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 1048 aa  317  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  41.12 
 
 		 928 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 		 1020 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 996 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 931 aa  306  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.89 
 
 		 1022 aa  300  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  39.12 
 
 		 967 aa  294  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  40.03 
 
 		 1003 aa  293  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 1108 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.45 
 
 		 1008 aa  290  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  38.92 
 
 		 964 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  39.28 
 
 		 941 aa  287  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 1017 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.69 
 
 		 992 aa  284  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.49 
 
 		 1011 aa  283  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.35 
 
 		 965 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 954 aa  282  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  38.71 
 
 		 908 aa  281  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 935 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  39 
 
 		 913 aa  278  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  37.99 
 
 		 965 aa  278  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.66 
 
 		 921 aa  277  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.47 
 
 		 993 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 654 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 1054 aa  264  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 992 aa  264  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.66 
 
 		 1138 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.95 
 
 		 1021 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 1025 aa  261  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.83 
 
 		 950 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  38.5 
 
 		 962 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.97 
 
 		 1013 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.92 
 
 		 956 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 970 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 993 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 621 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 989 aa  253  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 1034 aa  250  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.38 
 
 		 496 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.99 
 
 		 963 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 971 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 915 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 926 aa  244  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.65 
 
 		 928 aa  243  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 910 aa  242  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  31.7 
 
 		 790 aa  241  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 1346 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 1319 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 621 aa  235  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 453 aa  231  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 806 aa  230  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 612 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.9 
 
 		 1024 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  41.74 
 
 		 788 aa  227  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.61 
 
 		 632 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  40.99 
 
 		 757 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 982 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 		 910 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.74 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 755 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 981 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  35.4 
 
 		 937 aa  218  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  41.78 
 
 		 797 aa  217  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 		 814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.07 
 
 		 775 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 978 aa  207  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.6 
 
 		 994 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 850 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.06 
 
 		 915 aa  200  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  40.22 
 
 		 1004 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 622 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  40.58 
 
 		 838 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 1033 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.86 
 
 		 742 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.01 
 
 		 631 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.12 
 
 		 957 aa  188  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>