More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3993 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1081 aa  2155    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  45.67 
 
 		 1101 aa  877    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  38.64 
 
 		 1064 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  39.14 
 
 		 1047 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  61.87 
 
 		 1189 aa  1343    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1071 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 1059 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.89 
 
 		 1058 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1051 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1040 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1078 aa  529  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1065 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1105 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1093 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1068 aa  476  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.39 
 
 		 1028 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1038 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1073 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1074 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 1039 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1165 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1081 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1059 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1129 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1011 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1063 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1043 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1063 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1135 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1044 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 1088 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1127 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1087 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1043 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1234 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  30.22 
 
 		 1032 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1022 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1142 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.03 
 
 		 1071 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1138 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1033 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1147 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1036 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 1166 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1153 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 1065 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1027 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1163 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1041 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1059 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 		 1010 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1033 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1176 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1081 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1084 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.76 
 
 		 1025 aa  376  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1073 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1186 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1115 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1098 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 1083 aa  360  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1169 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1102 aa  356  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1137 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1153 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 		 1051 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1138 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1067 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1071 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 1098 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1099 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1072 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1088 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1057 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1116 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1008 aa  291  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1046 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1040 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 1037 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1038 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1161 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1051 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1124 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1128 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1014 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1181 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1155 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 999 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 1043 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 1063 aa  232  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1082 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1064 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1085 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 1038 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1050 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1039 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 1034 aa  226  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>