More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1525 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  54.74 
 
 		 848 aa  956    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  55.33 
 
 		 853 aa  1002    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  54 
 
 		 856 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  28.64 
 
 		 841 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  29.41 
 
 		 828 aa  399  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  28.67 
 
 		 839 aa  357  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  28.27 
 
 		 853 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  27.5 
 
 		 877 aa  332  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  27.73 
 
 		 843 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  24.7 
 
 		 838 aa  238  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  28.04 
 
 		 857 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  24.22 
 
 		 831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  25.88 
 
 		 829 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  22.59 
 
 		 814 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  24.02 
 
 		 816 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  24.18 
 
 		 828 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1059 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  19.71 
 
 		 811 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1060 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1023 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1081 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  35.77 
 
 		 381 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1043 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1077 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 		 1082 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  33.86 
 
 		 942 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  41.82 
 
 		 1107 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1182 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  26.71 
 
 		 1025 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 1083 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 927 aa  66.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 986 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 		 996 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 1049 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.82 
 
 		 1065 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1004 aa  64.3  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1079 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  37.61 
 
 		 1002 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  24.78 
 
 		 849 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1016 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  36.09 
 
 		 914 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1027 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1096 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  36.84 
 
 		 993 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 753 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  40.62 
 
 		 992 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1042 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 1038 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  38.82 
 
 		 1104 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1026 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1021 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 1010 aa  62.4  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 1064 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 998 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 1028 aa  61.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1137 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1047 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1062 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1066 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1038 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 958 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1010 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1050 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  39 
 
 		 1173 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1071 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1062 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1038 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1064 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 971 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1101 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.51 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1047 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 991 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 999 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1114 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  33.64 
 
 		 1017 aa  58.9  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1037 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 854 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 1089 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  44.79 
 
 		 973 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 989 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1144 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1088 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 996 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1020 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1085 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1034 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 1039 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  33.03 
 
 		 1047 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  35.92 
 
 		 1003 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  39.53 
 
 		 1081 aa  58.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 971 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 780 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>