266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1117 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 582 aa  1173    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  61.71 
 
 		 574 aa  723    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  61.72 
 
 		 580 aa  762    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  59.41 
 
 		 575 aa  696    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 634 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  27.39 
 
 		 550 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.39 
 
 		 619 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  26.06 
 
 		 781 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  25.08 
 
 		 781 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.18 
 
 		 777 aa  124  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  25.38 
 
 		 785 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.27 
 
 		 790 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.76 
 
 		 617 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  25.35 
 
 		 537 aa  117  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  25.13 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  23.63 
 
 		 774 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  24.75 
 
 		 798 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.53 
 
 		 670 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.88 
 
 		 798 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.59 
 
 		 797 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  24.59 
 
 		 852 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.74 
 
 		 723 aa  103  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 753 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  23.34 
 
 		 807 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  24.92 
 
 		 762 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 753 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.16 
 
 		 676 aa  95.5  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.95 
 
 		 654 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.71 
 
 		 785 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 753 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.59 
 
 		 938 aa  90.9  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25 
 
 		 754 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  25.17 
 
 		 773 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  23.75 
 
 		 754 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.57 
 
 		 712 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  24.96 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.63 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  21.31 
 
 		 841 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.86 
 
 		 772 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  23.04 
 
 		 766 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  22.8 
 
 		 766 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  23.39 
 
 		 766 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  23.37 
 
 		 766 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  23.37 
 
 		 766 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  24.12 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.63 
 
 		 756 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  23.65 
 
 		 757 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  23.23 
 
 		 766 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  25.86 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  21.52 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  23.87 
 
 		 758 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  24.4 
 
 		 766 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  27.2 
 
 		 722 aa  75.5  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  22.99 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25.68 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  24.05 
 
 		 758 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  26.4 
 
 		 874 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  23.75 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  23.04 
 
 		 644 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  26.3 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  23.04 
 
 		 646 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  28.57 
 
 		 723 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  28.32 
 
 		 669 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  22.81 
 
 		 761 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  20.72 
 
 		 835 aa  70.9  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.8 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  23.09 
 
 		 855 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  23.84 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  25.78 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  27.43 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.61 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.08 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25.17 
 
 		 746 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  23.21 
 
 		 636 aa  67  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25.17 
 
 		 755 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25.17 
 
 		 755 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  23.72 
 
 		 629 aa  67  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.08 
 
 		 793 aa  67  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  23.31 
 
 		 1067 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  21.24 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.48 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  22.26 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.43 
 
 		 773 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  23.94 
 
 		 855 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  23.86 
 
 		 849 aa  65.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.58 
 
 		 790 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  22.17 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  23.46 
 
 		 676 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.66 
 
 		 957 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  24.41 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  23.02 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  22 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  22 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  22.35 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  22.35 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  24.76 
 
 		 749 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>