78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0348 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  89.51 
 
 		 2268 bp  2615    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0348    100 
 
 		 2260 bp  4480    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  83.62 
 
 		 2226 bp  1407    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21750    86.06 
 
 		 3318 bp  252  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  91.53 
 
 		 2322 bp  77.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1544    95.56 
 
 		 2414 bp  73.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  91.07 
 
 		 2274 bp  71.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  92.31 
 
 		 2910 bp  71.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  91.07 
 
 		 2391 bp  71.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2394 bp  69.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 2373 bp  69.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  92 
 
 		 2352 bp  67.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  97.37 
 
 		 2577 bp  67.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  95.12 
 
 		 2337 bp  65.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  93.18 
 
 		 2379 bp  63.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  93.18 
 
 		 2304 bp  63.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  93.18 
 
 		 2265 bp  63.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  93.18 
 
 		 2430 bp  63.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  97.22 
 
 		 2274 bp  63.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  91.67 
 
 		 2286 bp  63.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  90.38 
 
 		 2394 bp  63.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  90.38 
 
 		 2340 bp  63.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  93.02 
 
 		 2199 bp  61.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  94.87 
 
 		 2415 bp  61.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  93.02 
 
 		 2262 bp  61.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  94.87 
 
 		 2361 bp  61.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 		 2316 bp  61.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  94.87 
 
 		 2520 bp  61.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  91.49 
 
 		 2298 bp  61.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 		 2322 bp  61.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  93.02 
 
 		 2478 bp  61.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  97.14 
 
 		 2391 bp  61.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  94.74 
 
 		 2814 bp  60  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  94.74 
 
 		 2199 bp  60  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  94.74 
 
 		 2373 bp  60  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  94.59 
 
 		 2280 bp  58  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  88.68 
 
 		 2346 bp  58  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  88.68 
 
 		 2316 bp  58  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  100 
 
 		 2280 bp  58  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  92.68 
 
 		 2337 bp  58  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  88.68 
 
 		 2193 bp  58  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  94.59 
 
 		 2316 bp  58  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  88.46 
 
 		 2202 bp  56  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  94.44 
 
 		 2217 bp  56  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2412 bp  56  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2916 bp  56  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2343 bp  56  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2163 bp  56  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  90.7 
 
 		 2367 bp  54  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  92.31 
 
 		 2412 bp  54  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  90.7 
 
 		 2178 bp  54  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  90.7 
 
 		 2361 bp  54  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  96.77 
 
 		 2316 bp  54  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  86.44 
 
 		 2712 bp  54  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  90.7 
 
 		 2295 bp  54  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  96.77 
 
 		 2187 bp  54  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  89.13 
 
 		 2193 bp  52  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  96.67 
 
 		 2016 bp  52  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  96.67 
 
 		 2169 bp  52  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  94.12 
 
 		 2454 bp  52  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2376 bp  52  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2292 bp  52  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  92.11 
 
 		 2394 bp  52  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2328 bp  52  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  89.13 
 
 		 2310 bp  52  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  86.79 
 
 		 2265 bp  50.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  86.79 
 
 		 2343 bp  50.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  85.25 
 
 		 2604 bp  50.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  91.89 
 
 		 2562 bp  50.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  87.76 
 
 		 2424 bp  50.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  86.79 
 
 		 2343 bp  50.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  96.55 
 
 		 2022 bp  50.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  91.89 
 
 		 2589 bp  50.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  96.55 
 
 		 2388 bp  50.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  91.89 
 
 		 2304 bp  50.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  91.89 
 
 		 2373 bp  50.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  93.94 
 
 		 2115 bp  50.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  91.89 
 
 		 2373 bp  50.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>