100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30220  transposase  97.66 
 
 		 642 bp  1154    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  97.56 
 
 		 642 bp  1102    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  97.35 
 
 		 642 bp  1138    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  100 
 
 		 642 bp  1273    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21750    100 
 
 		 3318 bp  6577    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  96.42 
 
 		 603 bp  997    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  100 
 
 		 642 bp  1273    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  97.98 
 
 		 642 bp  1170    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  100 
 
 		 642 bp  1273    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  98.58 
 
 		 351 bp  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29370    97.57 
 
 		 945 bp  1689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  97.73 
 
 		 441 bp  795    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  100 
 
 		 642 bp  1273    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  97.41 
 
 		 510 bp  892    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  97.98 
 
 		 642 bp  1170    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  97.2 
 
 		 642 bp  1130    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  97.98 
 
 		 642 bp  1170    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  97.28 
 
 		 318 bp  519  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  95.18 
 
 		 309 bp  492  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  92.82 
 
 		 384 bp  492  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  85.67 
 
 		 2226 bp  272  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0348    86.06 
 
 		 2260 bp  252  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  84.76 
 
 		 2268 bp  244  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  89.47 
 
 		 567 bp  87.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  80.63 
 
 		 2286 bp  85.7  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  91.23 
 
 		 531 bp  73.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  87.01 
 
 		 2274 bp  73.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  92.31 
 
 		 2916 bp  71.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  86.25 
 
 		 947 bp  71.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2394 bp  69.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    100 
 
 		 567 bp  69.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  87.32 
 
 		 2352 bp  69.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    85.54 
 
 		 276 bp  69.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  88.71 
 
 		 2373 bp  67.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  86.96 
 
 		 2304 bp  65.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  86.96 
 
 		 2316 bp  65.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  93.18 
 
 		 2262 bp  63.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  97.22 
 
 		 2391 bp  63.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  91.67 
 
 		 2265 bp  63.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  93.18 
 
 		 2199 bp  63.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 		 2712 bp  61.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  84.81 
 
 		 2517 bp  61.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  88.89 
 
 		 2595 bp  60  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 2016 bp  60  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  86.36 
 
 		 2337 bp  60  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  86.36 
 
 		 2337 bp  60  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  88.89 
 
 		 955 bp  60  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  88.89 
 
 		 955 bp  60  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  94.74 
 
 		 2373 bp  60  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  91.11 
 
 		 2379 bp  58  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  88.68 
 
 		 2670 bp  58  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  92.68 
 
 		 567 bp  58  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  96.97 
 
 		 2115 bp  58  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  88.68 
 
 		 348 bp  58  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  94.44 
 
 		 2373 bp  56  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1544    90.91 
 
 		 2414 bp  56  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  85.29 
 
 		 2361 bp  56  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  89.58 
 
 		 381 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  90.91 
 
 		 2478 bp  56  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  84.72 
 
 		 2244 bp  56  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  89.58 
 
 		 717 bp  56  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  89.36 
 
 		 2814 bp  54  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  86.44 
 
 		 2169 bp  54  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  90.7 
 
 		 2163 bp  54  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  89.36 
 
 		 2322 bp  54  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  92.31 
 
 		 2361 bp  54  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2340 bp  52  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2376 bp  52  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2316 bp  52  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  87.04 
 
 		 519 bp  52  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  87.04 
 
 		 955 bp  52  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  87.04 
 
 		 519 bp  52  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  87.04 
 
 		 955 bp  52  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2577 bp  52  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  92.11 
 
 		 2199 bp  52  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    94.12 
 
 		 943 bp  52  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  88.89 
 
 		 2430 bp  50.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  96.55 
 
 		 2172 bp  50.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 921 bp  50.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.672675  normal  0.826061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  88.89 
 
 		 2316 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  100 
 
 		 1134 bp  50.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  87.76 
 
 		 408 bp  50.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  91.89 
 
 		 2292 bp  50.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  88.89 
 
 		 2322 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  96.55 
 
 		 3408 bp  50.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  86.79 
 
 		 2217 bp  50.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90.24 
 
 		 962 bp  50.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  88.89 
 
 		 2343 bp  50.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  84.06 
 
 		 2412 bp  50.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>