288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4038 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  64.16 
 
 		 319 aa  235  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  62.35 
 
 		 319 aa  226  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  61.85 
 
 		 176 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  61.27 
 
 		 176 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  61.85 
 
 		 176 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  61.85 
 
 		 176 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  58.72 
 
 		 318 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  58.72 
 
 		 317 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  58.72 
 
 		 318 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  58.72 
 
 		 317 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  58.14 
 
 		 172 aa  220  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  58.14 
 
 		 172 aa  220  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  59.52 
 
 		 318 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  59.88 
 
 		 168 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  56.89 
 
 		 315 aa  203  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  56.89 
 
 		 315 aa  203  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  55.03 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  55.03 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  55.03 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  55.03 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  55.03 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  55.03 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  56.29 
 
 		 314 aa  201  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.47 
 
 		 314 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  54.44 
 
 		 213 aa  201  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  54.44 
 
 		 213 aa  201  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 238 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  54.49 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  53.85 
 
 		 213 aa  197  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  53.85 
 
 		 213 aa  197  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  53.85 
 
 		 213 aa  197  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  55.36 
 
 		 283 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  54.49 
 
 		 315 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.53 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.29 
 
 		 188 aa  193  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  54.17 
 
 		 315 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  54.17 
 
 		 315 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  54.49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  53.89 
 
 		 213 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  53.89 
 
 		 213 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.49 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  53.89 
 
 		 213 aa  187  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  52.1 
 
 		 188 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  52.1 
 
 		 188 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  52.66 
 
 		 227 aa  187  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  53.94 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  52.98 
 
 		 315 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  52.98 
 
 		 315 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  52.98 
 
 		 315 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  52.98 
 
 		 315 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  52.98 
 
 		 315 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  51.5 
 
 		 188 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  53.57 
 
 		 315 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  53.57 
 
 		 315 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  53.57 
 
 		 315 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  53.57 
 
 		 315 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  52.1 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>