76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2333 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2333    100 
 
 		 943 bp  1869    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  96.36 
 
 		 504 bp  93.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  81.1 
 
 		 852 bp  79.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  87.01 
 
 		 642 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  87.01 
 
 		 684 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  97.37 
 
 		 510 bp  67.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  95.24 
 
 		 567 bp  67.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  88.52 
 
 		 946 bp  65.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  89.47 
 
 		 507 bp  65.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  86.11 
 
 		 946 bp  63.9  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  86.11 
 
 		 946 bp  63.9  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2358    86.11 
 
 		 1776 bp  63.9  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2080    90.38 
 
 		 552 bp  63.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  88.14 
 
 		 531 bp  61.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  88.14 
 
 		 531 bp  61.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  88.14 
 
 		 531 bp  61.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  85.33 
 
 		 947 bp  61.9  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  85.33 
 
 		 947 bp  61.9  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  88.14 
 
 		 531 bp  61.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  86.89 
 
 		 348 bp  58  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  87.72 
 
 		 477 bp  58  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  94.44 
 
 		 642 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  94.44 
 
 		 309 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  83.75 
 
 		 507 bp  56  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  90.7 
 
 		 955 bp  54  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  92.31 
 
 		 947 bp  54  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29370    94.12 
 
 		 945 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  94.12 
 
 		 351 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  94.12 
 
 		 510 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21750    94.12 
 
 		 3318 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  94.12 
 
 		 642 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  96.55 
 
 		 603 bp  50.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2610    85.51 
 
 		 239 bp  50.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0907048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1970    96.55 
 
 		 360 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.446245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90.24 
 
 		 944 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0483    90.24 
 
 		 946 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  90.24 
 
 		 552 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0075    96.43 
 
 		 1108 bp  48.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0737393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4598    93.75 
 
 		 571 bp  48.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8799    91.67 
 
 		 417 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.806351  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8454  transposase and inactivated derivatives-like protein  91.67 
 
 		 504 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.52 
 
 		 947 bp  48.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>