More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2359 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  100 
 
 
315 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  100 
 
 
315 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  99.37 
 
 
314 aa  638    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  68.91 
 
 
315 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  68.91 
 
 
315 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  70.79 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  70.3 
 
 
213 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  70.3 
 
 
213 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  70.3 
 
 
213 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  69.8 
 
 
227 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.37 
 
 
315 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.1 
 
 
314 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  56.02 
 
 
283 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  47.65 
 
 
315 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  47.65 
 
 
315 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  47.65 
 
 
315 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  47.65 
 
 
315 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  47.65 
 
 
315 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  47.94 
 
 
315 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  46.67 
 
 
314 aa  258  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  46.35 
 
 
314 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  46.96 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  46.96 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  46.96 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  46.96 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  44.97 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  70.48 
 
 
168 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  68.68 
 
 
183 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  43.53 
 
 
318 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  43.53 
 
 
318 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.01 
 
 
320 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  43.22 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  70.3 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  43.22 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  56.93 
 
 
238 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  39.75 
 
 
319 aa  225  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  57.92 
 
 
188 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  42.06 
 
 
319 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.28 
 
 
188 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  54.27 
 
 
213 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  54.27 
 
 
213 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  54.27 
 
 
213 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  54.27 
 
 
213 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  54.27 
 
 
213 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  54.27 
 
 
213 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  54.27 
 
 
213 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  53.77 
 
 
213 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  53.2 
 
 
213 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  53.27 
 
 
213 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  53.27 
 
 
213 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  54.35 
 
 
188 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  54.35 
 
 
188 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  56.89 
 
 
176 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  56.89 
 
 
176 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  56.89 
 
 
176 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  56.89 
 
 
176 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  53.8 
 
 
188 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  54.35 
 
 
188 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  58.18 
 
 
168 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  54.59 
 
 
200 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  56.97 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>