More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0348 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  61.04 
 
 		 213 aa  200  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  61.04 
 
 		 213 aa  199  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  61.04 
 
 		 213 aa  199  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  61.04 
 
 		 213 aa  199  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  61.04 
 
 		 213 aa  199  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  61.04 
 
 		 213 aa  199  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  61.04 
 
 		 213 aa  199  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  61.04 
 
 		 213 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  60.39 
 
 		 169 aa  198  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  60.39 
 
 		 213 aa  197  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  60.39 
 
 		 213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  60.39 
 
 		 213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 		 157 aa  194  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  59.74 
 
 		 315 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 		 157 aa  194  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  56.05 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  54.78 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  59.74 
 
 		 188 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  54.78 
 
 		 188 aa  190  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.44 
 
 		 314 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  62.5 
 
 		 200 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  56.49 
 
 		 315 aa  184  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  57.14 
 
 		 314 aa  184  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  56.49 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  56.49 
 
 		 314 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  55.19 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.44 
 
 		 320 aa  178  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  57.72 
 
 		 191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  53.9 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  55.19 
 
 		 315 aa  175  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  55.19 
 
 		 315 aa  175  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  54.55 
 
 		 314 aa  172  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  52.6 
 
 		 315 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  52.23 
 
 		 283 aa  170  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  51.95 
 
 		 315 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  51.95 
 
 		 315 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  52.6 
 
 		 318 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  49.68 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  50 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  51.3 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  50 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  50 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>