27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2080 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2080    100 
 
 
552 bp  1094    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    90.38 
 
 
943 bp  63.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  84.34 
 
 
946 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  84.34 
 
 
946 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  84.34 
 
 
946 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2358    84.34 
 
 
1776 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313979  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  87.04 
 
 
947 bp  52  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  87.04 
 
 
947 bp  52  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  91.89 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  82.02 
 
 
684 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
507 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  82.02 
 
 
642 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>