37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2358 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  100 
 
 		 946 bp  1875    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  99.79 
 
 		 946 bp  1859    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  100 
 
 		 946 bp  1875    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2358    100 
 
 		 1776 bp  3521    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  95.38 
 
 		 684 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  95.38 
 
 		 642 bp  105  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  95.16 
 
 		 507 bp  99.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  87.21 
 
 		 947 bp  83.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  87.21 
 
 		 947 bp  83.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0483    88.89 
 
 		 946 bp  79.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  88.89 
 
 		 552 bp  79.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  84.21 
 
 		 504 bp  69.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    86.11 
 
 		 943 bp  63.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2080    84.34 
 
 		 552 bp  61.9  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4262    88.64 
 
 		 958 bp  48.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  100 
 
 		 411 bp  48.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>