More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2108 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  100 
 
 
227 aa  471  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  98.12 
 
 
213 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  97.65 
 
 
213 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  97.18 
 
 
213 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  97.18 
 
 
213 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  97.02 
 
 
168 aa  342  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  69.8 
 
 
315 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  69.8 
 
 
315 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  70.35 
 
 
314 aa  296  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  63 
 
 
315 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  63 
 
 
315 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  56.52 
 
 
283 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  67.78 
 
 
183 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58 
 
 
315 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  55.24 
 
 
238 aa  238  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.78 
 
 
314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 
167 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.95 
 
 
188 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  50 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  50 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  50 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  50 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.04 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  49.53 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  49.53 
 
 
213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  49.53 
 
 
213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  49.53 
 
 
213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  51.22 
 
 
318 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  50.49 
 
 
213 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  49.06 
 
 
213 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  49.06 
 
 
213 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  49.51 
 
 
315 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  49.51 
 
 
315 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  49.51 
 
 
315 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  49.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  49.51 
 
 
315 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  49.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  49.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  49.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  49.51 
 
 
315 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  50 
 
 
315 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  51.91 
 
 
188 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  51.91 
 
 
188 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
169 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  48.5 
 
 
314 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  51.37 
 
 
188 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  51.37 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  48 
 
 
314 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  50 
 
 
200 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  54.49 
 
 
168 aa  191  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.24 
 
 
320 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  52.66 
 
 
176 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  52.66 
 
 
176 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  52.66 
 
 
176 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  52.66 
 
 
176 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  45.59 
 
 
319 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  44.12 
 
 
318 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  44.12 
 
 
318 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  44.12 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  44.12 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  51.81 
 
 
169 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  52.56 
 
 
157 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  52.56 
 
 
157 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  51.23 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  50 
 
 
176 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  50 
 
 
176 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  50 
 
 
176 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>