15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0483 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  98.91 
 
 		 552 bp  1035    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  99.01 
 
 		 411 bp  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0483    100 
 
 		 946 bp  1875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  81.68 
 
 		 947 bp  424  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  81.68 
 
 		 947 bp  424  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2358    88.89 
 
 		 1776 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  88.89 
 
 		 946 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  88.89 
 
 		 946 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  88.89 
 
 		 946 bp  79.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  87.5 
 
 		 567 bp  63.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6314    92.86 
 
 		 601 bp  60  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    89.36 
 
 		 567 bp  54  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  87.04 
 
 		 567 bp  52  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    90.24 
 
 		 943 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  82.14 
 
 		 852 bp  48.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>