68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4162 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  91.01 
 
 		 567 bp  720    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    100 
 
 		 567 bp  1124    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.24 
 
 		 944 bp  363  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  83.85 
 
 		 567 bp  270  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1970    79.4 
 
 		 360 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.446245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1960    80.15 
 
 		 351 bp  111  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    87.1 
 
 		 276 bp  89.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.36 
 
 		 947 bp  85.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6072    87.8 
 
 		 285 bp  83.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4238    87.5 
 
 		 177 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  97.73 
 
 		 309 bp  79.8  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  87.5 
 
 		 717 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  87.5 
 
 		 381 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8454  transposase and inactivated derivatives-like protein  86.25 
 
 		 504 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8799    86.25 
 
 		 417 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.806351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  100 
 
 		 510 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  100 
 
 		 603 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21750    100 
 
 		 3318 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29370    100 
 
 		 945 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  100 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  100 
 
 		 351 bp  69.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  87.14 
 
 		 507 bp  67.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  88.52 
 
 		 531 bp  65.9  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  88.52 
 
 		 531 bp  65.9  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  88.52 
 
 		 531 bp  65.9  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  88.52 
 
 		 531 bp  65.9  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    93.02 
 
 		 568 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  97.14 
 
 		 642 bp  61.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  97.14 
 
 		 642 bp  61.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  97.14 
 
 		 642 bp  61.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  87.1 
 
 		 947 bp  60  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  92.68 
 
 		 947 bp  58  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    92.68 
 
 		 3176 bp  58  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  92.68 
 
 		 947 bp  58  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  92.68 
 
 		 947 bp  58  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  92.68 
 
 		 947 bp  58  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  92.68 
 
 		 947 bp  58  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    90.91 
 
 		 962 bp  56  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1041    83.54 
 
 		 227 bp  54  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  89.36 
 
 		 552 bp  54  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0483    89.36 
 
 		 946 bp  54  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  92.31 
 
 		 513 bp  54  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  85.48 
 
 		 958 bp  52  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9625    92.11 
 
 		 195 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.018149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    82.22 
 
 		 956 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0233    83.78 
 
 		 598 bp  52  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  85.96 
 
 		 576 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  91.89 
 
 		 348 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  100 
 
 		 2742 bp  48.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 969 bp  48.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  85.71 
 
 		 955 bp  48.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    82.14 
 
 		 932 bp  48.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  100 
 
 		 2727 bp  48.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>