26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0058 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0058    100 
 
 		 956 bp  1895    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    96.9 
 
 		 932 bp  833    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3764    83.05 
 
 		 941 bp  620  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  83.54 
 
 		 576 bp  379  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  85.26 
 
 		 384 bp  309  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  83 
 
 		 372 bp  220  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  82.9 
 
 		 387 bp  216  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0552    89.61 
 
 		 765 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    86.36 
 
 		 568 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.69 
 
 		 944 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  88.52 
 
 		 567 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6825    92.86 
 
 		 205 bp  60  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    81.82 
 
 		 962 bp  60  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    87.93 
 
 		 3176 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0233    94.29 
 
 		 598 bp  54  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    82.22 
 
 		 567 bp  52  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  94.12 
 
 		 363 bp  52  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  91.67 
 
 		 958 bp  48.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.71 
 
 		 947 bp  48.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7908    80 
 
 		 166 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    88.64 
 
 		 276 bp  48.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>