51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0233 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0233    100 
 
 
598 bp  1185    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.92 
 
 
962 bp  595  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    87.04 
 
 
962 bp  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1467    88.1 
 
 
183 bp  131  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0962    87.79 
 
 
168 bp  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0803  hypothetical protein  97.62 
 
 
219 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  85.14 
 
 
567 bp  60  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  84.42 
 
 
522 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  100 
 
 
1479 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  100 
 
 
384 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
639 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  90.7 
 
 
381 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    94.29 
 
 
932 bp  54  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    94.29 
 
 
956 bp  54  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  90.7 
 
 
717 bp  54  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  85.48 
 
 
348 bp  52  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    83.78 
 
 
567 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4760  potassium-transporting ATPase subunit B  100 
 
 
2145 bp  50.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3764    93.94 
 
 
941 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>