117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0586 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
212 aa  257  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  256  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  68.25 
 
 
127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  62.93 
 
 
320 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  52.42 
 
 
128 aa  123  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  52.54 
 
 
120 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.65 
 
 
315 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  55 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  50 
 
 
128 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  47.62 
 
 
127 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  54.92 
 
 
128 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  47.83 
 
 
314 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  47.83 
 
 
314 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  46.09 
 
 
315 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  45.53 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  46.09 
 
 
315 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  46.09 
 
 
315 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  46.09 
 
 
315 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  46.09 
 
 
315 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  39.37 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3765  hypothetical protein  86.49 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  0.890708 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  32.48 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  37.4 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  34.48 
 
 
315 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  34.48 
 
 
314 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  34.48 
 
 
315 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  33.9 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  34.21 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  33.33 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  33.33 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0375  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0669  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1106  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1848  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186981  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3559  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4578  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4730  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  35.04 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89352  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32610  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  36.11 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35600  transposase  36.08 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4478  ISSpo6, transposase orf A  32.11 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.966348  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4538  ISSpo6, transposase orf A  32.11 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  37.07 
 
 
318 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  32.11 
 
 
317 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  32.11 
 
 
318 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  32.11 
 
 
318 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  32.11 
 
 
317 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3698  putative insertion sequence transposase protein  34.43 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.04 
 
 
314 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  33.04 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  29.2 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  31.25 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3184  hypothetical protein  34.83 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0146  transposase  35.65 
 
 
318 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.97 
 
 
318 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  29.31 
 
 
319 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  40.48 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  35.85 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  35.85 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  35.85 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  35.85 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>