35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3731 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0058    96.9 
 
 		 956 bp  833    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    100 
 
 		 932 bp  1848    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  86.84 
 
 		 384 bp  349  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3764    83.23 
 
 		 941 bp  323  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  83.33 
 
 		 576 bp  297  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  84.68 
 
 		 387 bp  266  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  84.64 
 
 		 372 bp  264  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    87.84 
 
 		 568 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6825    88.41 
 
 		 205 bp  73.8  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0552    87.01 
 
 		 765 bp  73.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  88.52 
 
 		 567 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.69 
 
 		 944 bp  63.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    87.93 
 
 		 3176 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  87.93 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0233    94.29 
 
 		 598 bp  54  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  85.25 
 
 		 381 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    88.89 
 
 		 276 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  93.94 
 
 		 363 bp  50.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  85.25 
 
 		 717 bp  50.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.71 
 
 		 947 bp  48.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  91.67 
 
 		 958 bp  48.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    85.71 
 
 		 962 bp  48.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    82.14 
 
 		 567 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>