25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0552 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0552    100 
 
 
765 bp  1516    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  85.32 
 
 
1479 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  85.32 
 
 
384 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.32 
 
 
639 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.3 
 
 
962 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    89.61 
 
 
956 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    87.01 
 
 
932 bp  73.8  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3764    88.14 
 
 
941 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  82.47 
 
 
576 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    83.13 
 
 
568 bp  54  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  80.73 
 
 
384 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  96.43 
 
 
813 bp  48.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3765  hypothetical protein  80.77 
 
 
234 bp  48.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  0.890708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6853    91.67 
 
 
387 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>