126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6256 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1007    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  92.26 
 
 
491 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  74.27 
 
 
490 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  58.39 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  57.7 
 
 
456 aa  340  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  99.36 
 
 
212 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  49.31 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  100 
 
 
127 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  29.83 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  28.79 
 
 
469 aa  161  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  30.15 
 
 
469 aa  159  8e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  30.92 
 
 
487 aa  158  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  33.88 
 
 
485 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  29.49 
 
 
451 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  68.25 
 
 
127 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  27.87 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  31.06 
 
 
493 aa  139  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5182  transposase  58.73 
 
 
127 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  62.93 
 
 
320 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5240  ISSpo6, transposase orf A  52.42 
 
 
128 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.65 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4172  ISSpo6, transposase orf A  52.54 
 
 
120 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2582  transposase  55 
 
 
123 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2585  transposase  54.92 
 
 
128 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2128  ISSpo6, transposase orf A  50 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632388  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8592  ISSpo6, transposase orf A  47.62 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  53.04 
 
 
315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  32.87 
 
 
461 aa  106  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  31.51 
 
 
488 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0376  hypothetical protein  56.67 
 
 
270 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  47.83 
 
 
314 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  47.83 
 
 
314 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  28.17 
 
 
505 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  28.17 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  46.09 
 
 
315 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  45.53 
 
 
128 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  46.09 
 
 
315 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  46.09 
 
 
315 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  46.09 
 
 
315 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  46.09 
 
 
315 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  26.96 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  25.93 
 
 
516 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  28.05 
 
 
484 aa  87.8  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  26.46 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  30.19 
 
 
461 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  27.9 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  40.32 
 
 
125 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32320  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfA protein  39.37 
 
 
146 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  26.03 
 
 
496 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3765  hypothetical protein  86.49 
 
 
77 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  0.890708 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5203  putative insertion sequence transposase protein  32.48 
 
 
131 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732934  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  25 
 
 
913 aa  64.3  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  28.21 
 
 
295 aa  62.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6905  putative insertion sequence transposase protein  37.4 
 
 
126 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  32.76 
 
 
319 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  34.48 
 
 
315 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  34.48 
 
 
314 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  34.48 
 
 
315 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0364  transposase  33.9 
 
 
116 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.86722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0233  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0962484  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0482  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241872  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0655  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0708  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0852  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0489445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1158  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143815  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1314  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1395  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0532397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1967  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2030  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2059  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2103  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2107  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2371  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.192342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2848  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2948  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3007  transposase  33.9 
 
 
116 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  34.21 
 
 
136 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  32.11 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  32.11 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  32.11 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  32.11 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  37.07 
 
 
318 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>