29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8591 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8591    100 
 
 
568 bp  1126    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    86.36 
 
 
956 bp  79.8  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    87.84 
 
 
932 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7908    81.9 
 
 
166 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6302    83 
 
 
498 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    93.02 
 
 
567 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3764    86.15 
 
 
941 bp  58  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.33 
 
 
947 bp  56  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  86.67 
 
 
576 bp  56  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  86.44 
 
 
567 bp  54  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0552    83.13 
 
 
765 bp  54  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  85.07 
 
 
513 bp  54  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4262    84.85 
 
 
958 bp  52  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  83.78 
 
 
381 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  83.78 
 
 
717 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2889    91.89 
 
 
545 bp  50.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  85.25 
 
 
958 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  90.24 
 
 
567 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  86.79 
 
 
507 bp  50.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    85.25 
 
 
276 bp  50.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 
2163 bp  48.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>