More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0479 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  57.28 
 
 
318 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  57.19 
 
 
319 aa  345  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  47.96 
 
 
318 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  47.96 
 
 
318 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  47.65 
 
 
317 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  47.65 
 
 
317 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.2 
 
 
315 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.65 
 
 
314 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  70.52 
 
 
176 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  70.52 
 
 
176 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  71.43 
 
 
176 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  69.94 
 
 
176 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  43.53 
 
 
314 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  43.53 
 
 
314 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  43.57 
 
 
315 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  42.72 
 
 
315 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  42.72 
 
 
315 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  42.72 
 
 
315 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  42.72 
 
 
315 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  42.72 
 
 
315 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  62.35 
 
 
176 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  62.35 
 
 
176 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  62.35 
 
 
176 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  62.35 
 
 
176 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  40.19 
 
 
315 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  40.19 
 
 
315 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  40.19 
 
 
315 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  40.19 
 
 
315 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  60.59 
 
 
172 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  60.59 
 
 
172 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  42.06 
 
 
315 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  42.06 
 
 
315 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  42.27 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  42.27 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  41.43 
 
 
314 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  45.66 
 
 
283 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.76 
 
 
320 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.94 
 
 
188 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  56.55 
 
 
168 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.76 
 
 
188 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  49.73 
 
 
188 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  49.73 
 
 
188 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  50.8 
 
 
188 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  46.57 
 
 
213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  46.57 
 
 
213 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  46.57 
 
 
213 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  46.57 
 
 
213 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  46.08 
 
 
213 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  46.08 
 
 
213 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  49.2 
 
 
188 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  46.08 
 
 
213 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  46.08 
 
 
213 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  45.67 
 
 
213 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  46.08 
 
 
213 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  46.08 
 
 
213 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  50.9 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  51.2 
 
 
169 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  45.05 
 
 
213 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  44.12 
 
 
227 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  44.55 
 
 
213 aa  169  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  46.81 
 
 
200 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  51.5 
 
 
183 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  50.64 
 
 
157 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  50.64 
 
 
157 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  48.21 
 
 
169 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  50.9 
 
 
191 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  50 
 
 
157 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  49.4 
 
 
173 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  49.4 
 
 
173 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  49.4 
 
 
173 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>