71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3938 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3938    100 
 
 		 276 bp  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  88.24 
 
 		 567 bp  107  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    87.1 
 
 		 567 bp  89.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.19 
 
 		 944 bp  87.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  85.86 
 
 		 947 bp  85.7  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  85.71 
 
 		 507 bp  83.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  85.87 
 
 		 309 bp  79.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.26 
 
 		 947 bp  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  92.73 
 
 		 348 bp  77.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8799    84 
 
 		 417 bp  71.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.806351  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8454  transposase and inactivated derivatives-like protein  84 
 
 		 504 bp  71.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  84.78 
 
 		 642 bp  71.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  69.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  69.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  69.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  69.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  69.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2828    86.67 
 
 		 3176 bp  69.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21750    85.54 
 
 		 3318 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  85.54 
 
 		 603 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  85.54 
 
 		 510 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  85.54 
 
 		 642 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  85.54 
 
 		 351 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29370    85.54 
 
 		 945 bp  69.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  87.88 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  87.88 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  87.88 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  87.88 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  85.53 
 
 		 477 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  85.53 
 
 		 477 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  85.53 
 
 		 477 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  85.53 
 
 		 477 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  85.53 
 
 		 477 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  85.53 
 
 		 477 bp  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  84.34 
 
 		 642 bp  61.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  84.34 
 
 		 642 bp  61.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  84.34 
 
 		 642 bp  61.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  90.2 
 
 		 944 bp  61.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  90.2 
 
 		 944 bp  61.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  82.8 
 
 		 567 bp  58  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3764    90.91 
 
 		 941 bp  56  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  56  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  56  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  56  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  86.67 
 
 		 947 bp  56  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  85.07 
 
 		 958 bp  54  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  84 
 
 		 477 bp  54  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  84 
 
 		 477 bp  54  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0288    94.29 
 
 		 606 bp  54  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8591    85.25 
 
 		 568 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    88.89 
 
 		 932 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  88.89 
 
 		 576 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2849  hypothetical protein  84.06 
 
 		 381 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  84.06 
 
 		 717 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    88.64 
 
 		 956 bp  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    89.74 
 
 		 962 bp  46.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1661  transposase and inactivated derivatives-like protein  93.55 
 
 		 246 bp  46.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>