293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2083 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 
158 aa  329  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  100 
 
 
158 aa  329  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 
158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 
158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 
158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 
158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 
158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  94.3 
 
 
158 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  62 
 
 
213 aa  198  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  62 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  61.33 
 
 
169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  61.33 
 
 
213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 
188 aa  195  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  55.41 
 
 
188 aa  195  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  61.33 
 
 
213 aa  194  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  61.33 
 
 
213 aa  194  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  54.78 
 
 
157 aa  192  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  56.05 
 
 
188 aa  193  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  54.78 
 
 
188 aa  191  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  57.79 
 
 
315 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  57.79 
 
 
188 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.84 
 
 
314 aa  186  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  55.84 
 
 
315 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  62.86 
 
 
200 aa  184  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  55.84 
 
 
314 aa  183  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  55.19 
 
 
314 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  54.55 
 
 
168 aa  180  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
188 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  57.05 
 
 
173 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  54.78 
 
 
283 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  55.19 
 
 
315 aa  176  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  55.19 
 
 
315 aa  176  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  55.7 
 
 
191 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  57.05 
 
 
320 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  54.55 
 
 
314 aa  174  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  53.25 
 
 
238 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  51.68 
 
 
315 aa  173  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  51.68 
 
 
315 aa  173  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  51.68 
 
 
315 aa  173  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  51.68 
 
 
315 aa  173  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.25 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  51.95 
 
 
315 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  51.95 
 
 
315 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  51.28 
 
 
169 aa  171  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  53.25 
 
 
318 aa  170  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  50.65 
 
 
315 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  50.65 
 
 
315 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  50.65 
 
 
315 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  50.65 
 
 
315 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  50.65 
 
 
315 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  51.3 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  49.35 
 
 
176 aa  163  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  49.35 
 
 
176 aa  163  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  49.35 
 
 
176 aa  163  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  49.35 
 
 
176 aa  163  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  49.36 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  51.3 
 
 
176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  51.3 
 
 
176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  51.3 
 
 
176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>