45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4235 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4235    100 
 
 		 962 bp  1907    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.97 
 
 		 962 bp  837    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0233    87.04 
 
 		 598 bp  551  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0962    88.27 
 
 		 168 bp  159  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1467    88.1 
 
 		 183 bp  131  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0803  hypothetical protein  98.53 
 
 		 219 bp  127  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7795    87.37 
 
 		 267 bp  93.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3730    87.01 
 
 		 138 bp  73.8  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.920532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  86.57 
 
 		 513 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.62 
 
 		 947 bp  60  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0058    81.82 
 
 		 956 bp  60  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1978    88.68 
 
 		 192 bp  58  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  85.94 
 
 		 522 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8005  hypothetical protein  92.5 
 
 		 138 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    90.91 
 
 		 567 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6831  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6429  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6854  transposase  82.14 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1479 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7500  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0630  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6151  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6104  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5621  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3910  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3553  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3456  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0586  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8443  transposase  96.43 
 
 		 384 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328808  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  96.43 
 
 		 639 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3731    85.71 
 
 		 932 bp  48.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  84.38 
 
 		 348 bp  48.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>