More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3301 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3301  putative transposase of insertion sequence  100 
 
 
170 aa  346  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  67.15 
 
 
320 aa  185  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  60.99 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  63.5 
 
 
173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8454  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.05 
 
 
167 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  53.62 
 
 
168 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  52.55 
 
 
188 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  52.9 
 
 
213 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  52.9 
 
 
213 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  52.9 
 
 
213 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  52.9 
 
 
213 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  52.9 
 
 
213 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  52.9 
 
 
213 aa  140  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  52.9 
 
 
213 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  52.9 
 
 
213 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  51.82 
 
 
188 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  52.14 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  52.55 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  51.45 
 
 
213 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  51.45 
 
 
213 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.28 
 
 
314 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  51.45 
 
 
213 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  47.52 
 
 
315 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  47.52 
 
 
315 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  48.2 
 
 
315 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  48.2 
 
 
315 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  48.2 
 
 
315 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  48.2 
 
 
315 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  48.2 
 
 
315 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  47.83 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  47.83 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  47.83 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  47.83 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  49.64 
 
 
314 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  47.48 
 
 
314 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.64 
 
 
315 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  48.91 
 
 
315 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  48.91 
 
 
315 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  49.26 
 
 
157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  47.48 
 
 
314 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  47.79 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  47.79 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  47.79 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  46.04 
 
 
315 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  47.79 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.1 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  47.06 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  47.06 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  47.06 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  47.06 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  47.06 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  47.06 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  45.99 
 
 
176 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  45.99 
 
 
176 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  45.99 
 
 
176 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  45.99 
 
 
176 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
168 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  45.07 
 
 
213 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  56.52 
 
 
200 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  45.32 
 
 
158 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  45.32 
 
 
158 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0776544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>