More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1104 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6023  transposase  100 
 
 		 315 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  100 
 
 		 315 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  68.91 
 
 		 315 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  68.91 
 
 		 315 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  68.27 
 
 		 314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50.79 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.82 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  63.68 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  63.18 
 
 		 213 aa  278  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  79.12 
 
 		 183 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  63 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  54.2 
 
 		 283 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  45.86 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  45.54 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  46.98 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.4 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  44.59 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  44.59 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  44.59 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  44.59 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  44.59 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  43.67 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  43.67 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  43.67 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  43.67 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  44.48 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  63.47 
 
 		 168 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  42.77 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  42.77 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  63.03 
 
 		 167 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  42.45 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  42.45 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  54.23 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  41.96 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.4 
 
 		 188 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  42.27 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  51.5 
 
 		 213 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  51.5 
 
 		 213 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  51.5 
 
 		 213 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  51.5 
 
 		 213 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  53.85 
 
 		 188 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  51 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  51 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  51 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  51 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  50.49 
 
 		 213 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  51 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  51 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  49.72 
 
 		 188 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  49.72 
 
 		 188 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  53.01 
 
 		 169 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  49.17 
 
 		 188 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  54.17 
 
 		 176 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  54.17 
 
 		 176 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  54.17 
 
 		 176 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  54.17 
 
 		 176 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  49.17 
 
 		 188 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  55.29 
 
 		 200 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  54.82 
 
 		 168 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4704  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  80 
 
 		 136 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0171761  normal  0.931612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  53.29 
 
 		 169 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  53.89 
 
 		 176 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  53.89 
 
 		 176 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  53.89 
 
 		 176 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  53.29 
 
 		 176 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  49.7 
 
 		 172 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  49.7 
 
 		 172 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  48.9 
 
 		 191 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  51.81 
 
 		 173 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  51.81 
 
 		 173 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  51.81 
 
 		 173 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  51.81 
 
 		 173 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>